在特许经营体系的建立过程中，特许经营的费用计算是特许经营合同中的重要内容，它涉及到特许人和受许人双方的利益，其计算方法的合理性和科学性，既是特许经营体系稳步发展的前提，也是其得以巩固的必要保障。
通常，受许人支付的费用一般有加盟金、附加费、利润提成等。加盟金是在缔结加盟合同时一次性支付的金额，是一次性取得特许经营权的费用。有的国家将加盟金一分为二，开业前作为开业费叫加盟金，开业后作为商标使用权和持续性指导服务缴纳的部分称为权利金。附加费是加盟金之外总部为加盟店服务的费用。利润提成是指总部每年从加盟店利润中抽取一个百分比。
在日、美等国，特许加盟方式已经比较成熟、规范，特许经营加盟费的计算和收取方法也比较固定，通常有毛利分配方式和营业额分配方式。其中，毛利分配方式有利于保证加盟店与总部之间利益取向的一致性，也便于总部及时了解加盟店的经营状况，加强经营管理。虽然其计算方法较复杂，对会计系统和计算机系统的要求也相应较高，但因其较符合特许方与受许方的共同利益而被广泛采用。
下表即为日本7-11公司特许经营的展店方式和向加盟店收取的费用的构成、标准，所采取的正是毛利分配为主的方式。
日本7-11便利店特许经营加盟的费用构成
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